为夯实食源性微生物全基因组测序(WGS)分析技术能力,补齐生物信息学、AI组学数据分析实操短板,助力微生物风险溯源、耐药风险评估工作提质增效,2026年6月30日至7月4日,国家食品安全风险评估中心在哈尔冰举办的食源性微生物全基因组测序及生物信息学分析技术培训班,云南省疾控中心(云南省预科院)检验中心派员参加。

本次培训为期3天,采用“理论授课+全程上机实操”一体化教学模式,生物信息核心课程分为四大模块,覆盖微生物基因组分析数据质控、清洗与组装、基因功能注释与风险基因筛查、核心基因组进化分析等。在标准化生物信息实操课程外,培训同步开设前沿专题研讨,邀请行业专家分享靶向高通量测序、OneHealth视角下食源性致病菌跨链条传播风险、高海拔地区微生物基因组特征等前沿研究成果,结合沙门氏菌、单增李斯特菌、克罗诺杆菌等常见食源性致病菌暴发监测案例,讲解基因组技术在公共卫生风险预警中的落地应用。每日课程设置答疑环节,参训人员结合实验室数据分析卡点与授课专家、全国各省市疾控技术骨干进行交流,互通各地基因组监测工作流程与项目经验,搭建跨区域技术协作渠道。

培训期间,各学员全程跟进全部理论课程与上机实操,完成从原始测序数据处理、基因组组装注释、风险基因筛查到进化树构建的完整分析流程,掌握本次培训Linux分析工具与标准化操作流程,解决了日常工作中批量基因组分析、菌株溯源分型的多项技术堵点。

本次培训提升了生物信息学实操与数据解读能力,有利于各省疾控中心结合本地食源性疾病监测、食品安全风险评估工作实际,把cgSNP溯源、耐药基因筛查、ANI同源分析等技术应用于致病菌暴发调查、微生物耐药长期监测工作,以全基因组测序数字化技术,全面提升云南省疾控中心(云南省预科院)食源性微生物风险评估专业化水平。

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